March 25th, 2006

homuncul

ПАНСПЕРМИЯ

Mars meteorite similar to bacteria-etched earth rocks
A new study of a meteorite that originated from Mars has revealed a series of microscopic tunnels that are similar in size, shape and distribution to tracks left on Earth rocks by feeding bacteria.
http://www.marstoday.com/news/viewpr.html?pid=19356

Bacteria Grown In Simulated Martian Environment
http://www.sciencedaily.com/releases/1999/06/990615080147.htm

Extremophilic microbes: various life styles
http://www.livescience.com/animalworld/050207_extremophiles.html
homuncul

NEUROSCIENCE

Behavioral and Brain Sciences
Special Issue: Sleep and Dreaming


Hobson, J. Allen, Pace-Schott, E. and Stickgold, R. (2000)
Dreaming and the Brain: Towards a Cognitive Neuroscience of Conscious States

Nielsen, Tore A. (2000)
Mentation in REM and NREM sleep: A review and possible reconciliation of two models

Revonsuo, Antti (2000)
The Reinterpretation of Dreams: An evolutionary hypothesis of the function of dreaming

Solms, Mark (2000)
Dreaming and REM sleep are controlled by different brain mechanisms

Vertes, Robert P. and Eastman, K. E. (2000)
The case against memory consolidation in REM sleep
Tags:
homuncul

БИОЛОГИЯ

еще один стереотип развенчан...

Nature Reviews Molecular Cell Biology, April 2006
Sperm guidance in mammals — an unpaved road to the egg

Contrary to the prevalent view, there seems to be no competition in the mammalian female genital tract among large numbers of sperm cells that are racing towards the egg. Instead, small numbers of the ejaculated sperm cells enter the Fallopian tube, and these few must be guided to make the remaining long, obstructed way to the egg. Here, we review the mechanisms by which mammalian sperm cells are guided to the egg.
http://www.nature.com/nrm/journal/v7/n4/abs/nrm1893.html
homuncul

NEUROSCIENCE

Обзор на neuroscience.ru:
"Факты, указывающие на существование домена живых и домена искусственных объектов в структуре индивидуального опыта"

С позиций системно-эволюционного подхода домен можно определить как закрепленный в связанных между собой функциональных системах индивидуальный опыт, отражающий взаимодействие субъекта с набором объектов или явлений внешней среды, принадлежащих одной категории.

С помощью PET- и fMRI- анализа мозга показано, что домены живых и неживых объектов имеют разные проекции на структуры мозга Области мозга, активные при предъявлении различных искусственных объектов, не активируются при предъявлении живых объектов и наоборот.
Характеристики компонентов в связанных с событиями потенциалах различны для живых и неживых объектов. Так, при предъявлении живых объектов амплитуда N400 в затылочно-теменных областях меньше, а амплитуда следующего за ним позитивного компонента больше, чем при предъявлении неживых объектов. А во фронто-центральных областях предъявление неживых объектов связано со снижением амплитуды N400 и увеличением амплитуды позднего позитивного компонента по сравнению с предъявлением живых объектов.

При повреждении определенной области мозга имеет место избирательное нарушение узнавания и воспроизведения и семантического оперирования словами, предметами, принадлежащими одному из доменов. В литературе описаны пациенты с избирательным нарушением знания о живых объектах. Такие люди, например, не могут назвать предъявленные им предметы, которые принадлежат живым категориям. Было показано, что при этом у таких пациентов остаётся сохранённым знание о неживых объектах. Нарушение знания о неживых объектах при сохранённом знании о живых объектах наблюдается реже.

Различия между этими двумя доменами можно обнаружить не только у человека. Например, голуби быстрее обучаются категоризировать живые объекты, по сравнению с искусственными.
В психологических исследованиях показано, что домены живых и искусственных объектов обладают разной внутренней структурой. В частности, показано, что категории искусственных объектов по сравнению с категориями живых объектов в большей степени демонстрируют ядерную структуру: (обладают ярко выраженными прототипами) и размытые границы, в то время как домены живых объектов в меньшей степени обладают ядерной структурой, а границы у них чёткие.

Полностью...
http://www.neuroscience.ru/content/view/355/100/
homuncul

NEUROSCIENCE

The Matrix' is a step closer to reality: neuroscientists break code on sight
http://www.physorg.com/news7879.html
http://www.membrana.ru/articles/global/2005/11/07/202700.html

neuroscientists in the McGovern Institute at MIT have been able to decipher a part of the code involved in recognizing visual objects. Practically speaking, computer algorithms used in artificial vision systems might benefit from mimicking these newly uncovered codes.

the researchers trained monkeys to recognize different objects grouped into categories, such as faces, toys and vehicles. The images appeared in different sizes and positions in the visual field. Recording the activity of hundreds of IT neurons produced a large database of IT neural patterns generated in response to each object under many different conditions.
the researchers used a computer algorithm, called a classifier, to decipher the code. The classifier was used to associate each object -- say, a monkey's face -- with a particular pattern of neural signals, effectively decoding neural activity. Remarkably, the classifier found that just a split second's worth of the neural signal contained specific enough information to identity and categorize the object, even at positions and sizes the classifier had not previously "seen."

It was quite surprising that so few IT neurons (several hundred out of millions) for such a short period of time contained so much precise information. "If we could record a larger population of neurons simultaneously, we might find even more robust codes hidden in the neural patterns and extract even fuller information," Poggio said.


Science, Nov. 2005
Fast Readout of Object Identity from Macaque Inferior Temporal Cortex

Исследователи, безусловно, молодцы: опыт несложный и в то же время интересный. Но с выводами о расшифровке распознавательного кода я бы не торопился. Нельзя быть уверенным, что различия в паттернах связаны исключительно с характеристиками визуальных образов...В любом случае, получены достаточно ценные результаты.
homuncul

ЭВОЛЮЦИЯ

Теоретическая статья. Очень любопытно...Автор предлагает вариант "эволюционного движка" в виде организованного сообщества рнк-молекул, которые реагируют на окружающие условия изменением биохимических стратегий, успешные из которых записывают на наследуемый носитель - ДНК. - Тем самым эволюция предстает не в виде череды ошибок репликации, а как процесс подбора и переключения стратегий в ответ на факторы внешней среды.

Biosystems, Jan. 2006
Department of Chemistry and Chemical Biology, Harvard University, Cambridge

Emerging evidence suggests that the introns and intergenic sequences of the genomes of higher eukaryotes (the "junk" DNA) codes for a vast, RNA-based, genetic regulatory network. It is believed that this network is responsible for the variety and complexity of terrestrial life. We conjecture that this regulatory network is more properly viewed as an RNA "community", composed of a rich and largely unexplored biochemical web of RNA interactions. Viewed as an RNA-community, we hypothesize that the RNA regulatory network of higher eukaryotes can re-wire itself, and employ various and evolvable mutational strategies in response to external pressures. Thus, we argue that much evolutionary change is due to intracellular, RNA-mediated learning processes. Successful strategies and pathways are then recorded (hard-wired) into the DNA genome via reverse transcriptase. We present evidence, which is consistent with this viewpoint, and make specific theorems, which could be used to test the utility of our framework. If essentially correct, the RNA-community view of eukaryotic cells could reconcile measured point mutation and gene duplication rates with actual rates of evolutionary change. Futhermore, the RNA-community view of eukaryotic cells suggests that agent-based modeling techniques, used in mathematical economics, game theory, and neuroscience, will likely be as useful in understanding the functioning of eukaryotic cells as the pathway-based approaches of systems biology. We conclude this paper by arguing that a sufficient amount of biological knowledge has been accumulated to initiate a systematic program of experimental and computational studies of the origins and macroevolution of terrestrial life.

Full text:
An RNA-centered view of eukaryotic cells